تنوع پلاسمیدهای باکتریهای سینوریزوبیوم (انسیفر)

نوع مقاله : مقالات پژوهشی

نویسندگان

• اسماعیل کریمی ¹
• امیر لکزیان ²
• کاظم خاوازی ³
• اصغر اصغر زاده ⁴

¹ گروه علوم و مهندسی خاک، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغه، مراغه، ایران

² دانشگاه فردوسی مشهد

³ موسسه تحقیقات خاک و اب تهران

⁴ موسسه تحقیقات خاک و آب تهران

10.22067/jsw.v0i22.980

چکیده

چکیده
شواهد ژنتیکی نشان داده است که باکتری‌های ریزوبیوم بدلیل داشتن ژنهای nod گیاهان لگوم را گره دار می‌کنند. تقریباًًًً تمام خانواده باکتری‌های ریزوبیاسه دارای پلاسمیدهای بزرگ هستند که از لحاظ اندازه و تعداد بسیار متغیر می‌باشند. معمولاًً ژن‌های nif و nod بر روی پلاسمید‌های هم‌زیست(Psym) قرار دارند. مطالعه تعداد و اندازه پلاسمیدها از طریق تکنیک پروفیل‌های پلاسمیدی می‌تواند به‌عنوان شاخصی از تنوع باکتری‌های ریزوبیوم در مطالعات اکولوژی استفاده شود. در این مطالعه تنوع پلاسمیدی 196 جدایه سینوریزوبیوم (انسیفر) جدا شده از خاک‌های استان همدان با استفاده از تکنیک پروفیل پلاسمیدی مورد ارزیابی و مطالعه قرارگرفت. نتایج آزمایش نشان داد که تعداد پلاسمیدها در بین جدایه‌ها بین 1 تا 4 پلاسمید تغییر می‌کند. به‌طور کلی 13 نوع پلاسمید مختلف در بین جدایه‌ها شناسایی شدند که اندازه آن‌ها از 50 تا 200 کیلو جفت بازآلی متغیر بود. جدایه‌هایی با 1، 2، 3 و 4 پلاسمید به ترتیب 63، 21، 13 و 2 درصد کل جدایه‌ها را تشکیل می‌دادند. جدایه‌های حاوی 2 و 3 پلاسمید به ترتیب 8 و 15 گروه مختلف پلاسمیدی گروه بندی شدند. چهار جدایه سینورزیوبیوم که دارای 4 پلاسمید بودند و در 4 گروه پلاسمیدی متفاوت قرار گرفتند. کل جدایه‌ها جمعادر 28 گروه پلاسمیدی گروه بندی شدند.

واژه‌های کلیدی: سینوریزوبیوم (انسیفر) ، پروفیل پلاسمیدی

---

عنوان مقاله [English]

Plasmid diversity of Sinorhizobium (Ensifer) bacteria

نویسندگان [English]

• E. Karimi ¹
• A. Lakziyan ²
• K. Khavazi ³
• A. Asgharzadeh ⁴

¹ Soil Science and Engineering Department , Faculty of Agriculture, University of Maragheh, Maragheh, Iran

² Ferdowsi University of Mashhad

³ Soil and Water Research Institute

⁴ Water and Soil Research Institute of Teheran

چکیده [English]

Abstract
Genetic evidences have shown that the rhizobium bacteria nodulate the legume plants because of nod, sym and fix genes. Almost all members of rhizobaceae family harbor large plasmids, which are highly variable in number and size. Representative of nif, fix and nod genes have been located on the symbiotic plasmids of different rhizobium species. Therefore, the size and numbers of plasmids of bacterial isolates (by the plasmid profile technique) could be used as a diversity index in ecological studies. In this investigation, the diversity of 196 isolates of sinorhizobium sp isolated from Hamada soils was evaluated by using Plasmid profile technique. The results showed that the number of plasmids among all isolates varied from 1 to 4 and totally 13 different plasmids were identified. The size of plasmids varied from 50 to 200 kb. Isolates with 1, 2, 3 and 4 plasmids formed 63, 21, 13 and 2 percentage of the population. Isolates of sinorhizobium with 2 and 3 plasmids were clustered into 8 and 15 groups, respectively, based on plasmid patterns. Four isolates which contained 4 plasmids were grouped in four different clusters and finally all isolates of Sinorhizobium (196) were grouped in 28 different groups.

Key words: Plasmid profiles, Sinorhizobium